医疗器械学院团总支由组织部、宣传部、社会实践部、创新创业部、学生党建服务部五个部门和48个班级团支部组成;
医疗器械学院学生会由综合管理部、新媒体工作部、志愿者工作部、生活事务部、对外联络部、社团管理部、文体部、心理部、学术部、学生自主管理委员会十个部门组成。
团总支书记:荀 琳
学生会主席、团总支学生副书记:王悦珵
团总支学生副书记:钱 宽
学生会副主席:王 傲
学生会副主席:薛涵哲
学生会副主席:罗炜川
学生会副主席:刘祎辰
组织部部长:张一博
组织部副部长:张 滢、董晨欣
宣传部(新媒体工作部)副部长:黄锦程
社会实践部部长:张路安
社会实践部副部长:薛晨凯、王思淇
创新创业部(学术部)部长:顾王婧
学生党建服务部部长:郭镇材
学生党建服务部副部长:王初阳
综合管理部部长:李嘉琦(18临工3班)
综合管理部副部长:张邹妍
志愿者工作部部长:朱 晴
志愿者工作部副部长:肖吕耀、叶钰凡
生活事务部部长:蒋安琦
生活事务部副部长:孙正卿
对外联络部副部长:陆佳怡
社团管理部部长:顾欣悦
社团管理部副部长:张喆瑜
文体部部长:李嘉琦(18精密1班)
文体部副部长:张嘉慧
心理部(心协医械分会)部长:严姝瑶
心理部(心协医械分会)副部长:王汤浩、王灏宇
学生自主管理委员会副部长:李 云
学生自主管理委员会副部长:徐佳妍